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2024年11月25日 星期一

我的外公外婆有遠親關係?


我的外公與外婆

GEDMatch有一個功能,就是用你的DNA來分析[父母親有沒有血緣關係]。一開始看到這功能覺得有點奇妙,阿不是規定三等親不能結婚,難道還有狗寫小說的情節嗎?後來想想,啊對,這又不是只針對台灣,而且中國以前很愛親上加親,這功能就能做分析。

然後無聊的我把家人們的DNA都做一次分析,赫然發現,我的外公、外婆有遠親關係?仔細一看,其實分析到的大於7cM的片段只有一段,感覺應該是很遠的親戚吧。

  

為了搞清楚這個工具的作用,我很認真地看了延伸閱讀: “When the DNAsays your parents are related,文章中解釋了他們是怎麼判斷父母親是否有血緣關係的:孩子從父母兩端遺傳到了相同的片段,稱為homozygous run。這個AYPR工具輩運用到一些亂倫的案例,比方文章中提到他們怎麼利用遺傳的方法,去確定某案例當事人他的父母其實是一對父女

嗯,看來我家沒這個問題,重合的片段挺短的。

該篇文章中提供了AYPR的工具來估計[父母]之間的親屬關係,我把7.9cM輸入後系統跟我說這超出他們的恕限值了,於是我只能用8 cM來估算。

估算的結果是一個機率表,我外公和外婆的遠親關係有24.1%的機率是3C group(例如兩個人有相同的高祖父);20%的機率是2C1R group(例如其中一位是另一位2nd cousin的孩子);18.9%的機率是3C1R group(例如3rd cousin的孩子);12.6%的機率是4C group(有同樣的[往上數5輩]的祖輩)。

我外公、外婆的可能親屬關係機率


系統給的圖,我看不懂


老實說我被這些英文縮寫搞得一個頭兩個大,看了另一篇文章”What is your DNA",裡面有個對照表格,感覺清楚多了。

親屬關係的縮寫以及shared DNA的上下界


我看了一下外公、外婆的祖輩,發現兩邊的高祖父母有三個相同的姓氏:陳、王、方,且這三家都在嘉義市區,感覺機會真的很大啊!可惜除了方家族譜比較齊全,其它都還沒找到資料。

 

外公、外婆的高祖輩     

外公  陳喜的父親、方大鼻的祖父、王綢()的祖父

外婆  陳國治的父親、方文辰、王鸞的父親

 

不同親屬關係的shared DNA一覽表

2024年11月13日 星期三

同時和我爸媽有遠親關係的奇妙案例: with加拿大的Johnson

 
這是野放海龜新聞上的地圖,我只是要用來顯示台灣~越南的相對位置

某天在GEDMatch上看到新的配對,一對多的工具上顯示我們的Generation4,這親屬關係距離有點遠又不會太遠,但看到gmail就覺得可以試看看。寫信過去後很快收到Johnson的回信,他現在住在加拿大,長輩來自越南。

我們後來互加了FB,稍微聊了一下,發現幾個有趣的巧合:

Johnson正在念滑鐵盧大學,而我兩個表哥以前也是!更巧的是我兩位表哥都是化工系畢業的,而Johnson原本念的也是化工,後來才轉到別的系。

我想著,如果Johnson是我爸這邊的親戚,那就可以讓他跟我兩個表弟相認一下,他們不僅是校友,還是遠親,應該也可以叫做「親上加親」了(冷)。

 

我比對了我跟JohnsonDNA,在chr 1, 4, 9, 16, 19, 22有匹配。

第一次遇到這麼多地方有匹配到的,我覺得有點興奮,是否能讓我找到消失的族譜呢?

我跟Johnson有match到的片段


老爸跟JohnsonDNA比對,兩人在chr 4, 9, 16有對到,chr 4, 9位置跟我的是一樣的,但是chr 16差很大。

這結果有點奇妙,表示我跟Johnson重合的DNA,分別來自我爸跟我媽。在53.5 cM的匹配中,只有20.2 cM跟我爸有關,其餘的33.3 cM則是來自我媽。而Johnson同時是我兩邊的遠親,關係比本來想的遠一點。

老爸跟Johnson有三個片段match,其中兩個傳給我,一個沒有


我也把我弟跟Johnson做了比較,只有chr 9有匹配。深深覺得DNA遺傳的機率非常有趣,我跟我弟也差太多了吧!


老弟只有chr 9跟Johnson有match

因為沒有阿母的DNA分析,我拿了二阿姨的DNAJohnson做比較,結果只有在chr 1上有匹配,跟我的位置還不一樣表示這一段要馬我媽沒遺傳到,要馬她沒傳給我。


阿姨跟Johnson只有chr 1有match

不死心的我,又拿了堂姑的DNA來比對,對到chr 9,但跟我的位置不一樣。


堂姑跟Johnson在chr 9有match,但跟我不同片段


比對半天只能確定我和Johnson相同的DNA中,chr 4,9的片段來自我爸,chr 1, 16, 19, 22的片段來自我媽,但是這樣的匹配量太小了,除非有完整的族譜,不然很難把關係找出來。看來我要找到失落的族譜,還需要更多運氣了。

2024年10月26日 星期六

X-DNA 一對一匹配 with汶萊的遠親

 

(照片取用自翰林雲端學院)

先前在MyHeritage上跟一位汶萊的先生Davidshared DNA,我跟他的老婆(他老婆幫他管理DNA)透過站內信做了很多交流,也在她的建議下開始研究GEDMatch這個網站的工具。

原本我們從MyHeritage的比對結果,推論我應該是她先生父親那邊的遠親,因為我跟她婆婆沒有匹配到。然後利用了GEDMatch比對後才發現,我應該是她先生母親那邊的親戚,因為我們有x-DNA match

二類組的我已經把生物忘光光了,雖然還記得女生是XX男生是XY,但還是需要想一下。於是我在網路上找文章看,然後稍微把國中生物撿回來一點。有X-DNA match應該可以推論我們往前溯源的過程,沒有父子這一條線,因為這樣X-DNA就傳不下去了。

網路上的文章中還提到,有可能發生有X-DNA匹配,但是沒有常染色體匹配的情況,這種情況發生在父~女,爸爸把X全部傳給女兒,但是常染色體剛好沒有傳到有匹配的部分。

David的母親姓楊,我跟她們的常染色體以及X匹配分別是這樣的

我的楊的常染色體比對

我跟David的常染色體比對

 我跟楊的x染色體比對

我跟Davidx染色體比對

可以發現我和他們母子的長染色體匹配都位於chr5,位置也差不多;x染色體匹配位置也類似,媽媽的匹配比較長有11 cM,兒子的是9.8 cM

 

老弟跟這對母子的長染色體在預設條件下沒有匹配,x染色體跟楊有配到耶。我居然一試就試到網站上提到的特殊情況

後來我把條件放寬一咪咪,老弟跟Davidx染色體也有匹配了。

老弟跟楊的x染色體比對

老弟跟Davidx染色體比對

老弟跟楊的匹配是7.7 cM,跟David6.5 cM。位置跟我的匹配很類似。


因為我跟我弟都跟那對母子有x-DNA匹配,可以確定應該是我媽那邊的遠親,於是我又拿我阿姨的來配看看了。用預設的條件來比對,雙方的常染色體沒有匹配,但是x染色體有。

阿姨的楊的x染色體比對

阿姨跟Davidx染色體比對

阿姨跟楊的匹配有11.4 cM,跟David的是7.6 cM。位置跟我、我弟的都很類似。

*******(後記) 

後來我把常染色體比對條件放寬,就有找到很短的匹配了。比較奇妙的是我爸跟楊也有9.2 cM的常染色體匹配,位於ch 10,但沒有傳給我跟我弟;我爸跟David則沒有匹配。這似乎表示無論我爸還是我媽的祖先,跟楊的爸媽可能都有很遠的親戚關係,真是複雜。

老爸和楊的常染色體比對